FreeSurfer系列教程

介绍

FreeSurfer是一款免费开源的用于分析和可视化来自横断面和纵向研究的神经影像数据软件包。它由 Martinos 生物医学成像中心的计算神经成像实验室开发。

FreeSurfer 为结构像和功能像提供完整的处理流,包括提供线性和非线性配准、皮质和皮质下分割、皮质表面重建、组形态测量统计分析、扩散像、PET分析等的工具。它也是 Human Connectome Project 的首选结构像分析软件。

有关使用和理解 FreeSurfer 工具的扩展文档,请访问FS Wiki

freesurfer

FreeSurfer能解决什么问题?

  • MRI的图像分割、配准
    • 颅骨剥离,B1偏场校正,灰白色质分割
    • 个体皮质表面与立体定向图谱的非线性配准
  • 皮质表面重建
    • 计算皮质厚度、曲率、灰质体积等
  • 皮层表面区域以及皮层下的大脑结构的标记
  • 组间差异分析以及可视化

参考资料

  1. 官网
  2. Freesurfer使用手册